首先了解二者在商业模式上的区别
自建平台是指仅限于自身经营品种的交易网站，属于“一对多”的商业模式。而第三方药品交易平台是独立的中立服务组织，属于“多对多”的网上集市模式，类似于阿里巴巴的“撮合模式”。
互联网经济的核心在于“开源节流”，例如按照原来的成本只能产生一个地区的覆盖率，但通过互联网技术能做到覆盖全国数十个地区的用户。自建平台和借力第三方平台的目的都在于此，利用信息化手段，实现企业降低成本创造收益的目标。
接下来再分析下企业自建B2B平台与第三方B2B平台的优劣势问题
平台开发
为拉动更多的线上交易，很多公司会选择将网站开发外包出去。虽然外包业务可以按照需求进行定制，也正因此容易忽略终端用户的实际消费模式和行为习惯，平台易变为另一个版本的ERP系统。那么，对于已经拥有强大的推广队伍的公司来说，线上平台并无太大价值。
在功能上看，第三方平台的专业优势突出。平台开发会从买卖双方的利益诉求考虑，最终平台的功能是符合整个市场需求的。而第三方平台的大量数据样本，还可为商业提供精准的推广服务，使其获得新客资源。
运营成本
平台建立后需要维系运转，这时会涉及到很高的人力成本支出。一个平台至少需要前端、设计、后台等专业性人才，按照5个员工算。每个员工一年10万工资，就需额外支出50万以上的人力成本，这个成本还是持续性投入的。一旦成本支出高，但网站流量和销量不如人意，此举实在是事倍功半。
相反，第三方交易平台原本就是专业从事平台运营的企业，技术手段非常成熟。关键还在于，入驻第三方平台的成本非常低，甚至是零成本入驻。据了解，目前像以药品终端网为代表的医药2B2网站都是免费使用。
集群效应
这是药企自建平台的一个致命劣势之一，单个药企的力量始终有限。当平台成立后，如何在线下基础上获得新的终端用户，如何留住既有的老客户呢？由于自建平台仅销售自营产品，商品品类非常有限。如果平台不能满足客户需求，客户必然会寻求资源更丰富，服务更完善的大平台，造成客户流失。长此以往，很难形成集群效应。
第三方交易平台，最大的功能在于大量聚集上下游企业。就像超级市场一样，入驻的商家多了，自然不愁没有客户加入。平台最终会形成稳定的流量，入驻商家完全可以坐享平台的流量红利。此外，入驻者还可以共享资源，享受到金融服务、营销服务等其他支持。
显而易见，医药B2B第三方平台将会是企业寻找转型之路的重要助力。相信在不久的未来，会有越来越多的药品商业公司转向与医药B2B电商寻求更深入的合作。而作为中国B2B电商百强的药品终端网，或将成为众多商业公司青睐的合作伙伴，重新洗牌医药互联网产业。
