2016年，对医药电商来说是复杂多变的一年，7月底8月初，天猫医药馆等3家互联网第三方药品销售平台网上药品零售试点被全部叫停，原本有望放开的网售处方药因此再次变得扑朔迷离。一方面政策收紧，另一方面医药电商本身的增速放缓，摆在眼前的融资、盈利等现实问题，也都使得医药电商之路再次变得坎坷不平。5月18日,药给力因为“融资和公司资金压力”,1小时送药上门业务停止。在整个医药电商领域，相对比较抢眼的O2O、B2C平台，第三方B2B平台因为本身的客户群体及发展现状，曝光率显然要低一些，不过回顾2016到2017年初，不少第三方医药电商B2B平台融资、对外合作的消息也频频见于各类媒体，在行业内也引发了不少的关注。
据不完全统计，商务部直报系统显示2015年医药电商销售总额达476亿元，其中B2B销售占比93%，B2C销售仅占医药电商销售总额的6.7%。而截止到2017年2月22日，据CFDA网站数据显示：各级药监部门颁发的《互联网药品交易服务资格证书》共有916张，其中B证224张、C证649张，A证获得企业仅43家，可以看出，相对而言A证企业竞争态势还远远不如C证企业那么激烈。正因为A证的稀缺性及整体市场规模，使得一些运营状况不错的A证企业在资本市场上往往能获得不错的估值，第三方医药B2B的平台也对资本更具吸引力。
在医药市场上，传统的批发采购模式弊端居多，例如流通环节中的信息不对称、开票问题、回款周期长等问题一直以来都是这个行业普遍存在的痛点，正是基于这些问题，第三方医药电商B2B模式就应运而生。对于采购商来说，B2B医药平台的价值在于平台药品种类齐全、价格透明、操作方便，信息传递更为高效，采购更便捷;对于上游供应商来说，B2B医药平台使其营销渠道管理更扁平化，营销费用更低，同时还能享受互联网带来的规模效应，进一步提升产品销量;一些有实力的平台甚至能够提供供应链金融服务，帮助上下游缓解资金压力，给上下游企业解决实际问题。相比于传统批发采购模式，医药电商B2B平台更有发展前景及优势。
但不可否认，医药电商B2B平台在现阶段也面临不少问题，比如物流配送、质量监管等问题也是这类平台不得不面临的实际问题。但是相信随着市场的日益成熟和用户接受度的进一步提高，加上平台自身的创新发展，这些问题将会迎刃而解，同时也会涌现出一些出类拔萃的企业。
就现阶段而言，受制于国内医药电商的整体发展进程，虽然部分有前瞻意识的企业已经开始这方面的试水，一些工业企业早已经与部分医药B2B平台展开合作，甚至有些生产、流通企业也成立自己的B2B电商平台(多为B证)。但是毕竟在平台运营方面的经验和技术优势不如A证平台企业，而拿到A证的企业在基础客户量方面是没有优势的，这个时候平台方和上游厂商开展商业合作，双方优势结合，上游借力于平台方的运营经验和专业技术优势，平台借力于上游的产品和基础客户量优势，共同发展。
